APEX établit des collaborations scientifiques variées avec des organismes publics (INRA, INSERM, CEA, IFREMER...).
Immunopathogénie de l’infection par des Alphavirus (Chikungunya et Ross-River Virus)
Collaboration initiée en novembre 2006 avec Pierre Roques (CEA, Service d'ImmunoVirologie, Fontenay-aux-Roses) et élargie depuis début 2008 à Andreas Suhrbier (Queensland Institute of Medical Research, Brisbane, Australie).
En 2005 et 2006, près de 300 000 cas de Chikungunya ont été recensés sur l’Île de la Réunion, 250 patients sont décédés. La réémergence du virus responsable de cette maladie, en Inde et dans les îles de l’Océan Indien, a souligné la nécessité de mieux en comprendre les mécanismes afin de trouver les moyens de la prévenir.
Depuis les résultats obtenus sur la caractérisation de la physiopathogénie du chikungunya sur un modèle d’infection simien (Labadie et al, J Clin Invest, 2010), nous avons développé un modèle murin adulte (Gardner J et al., J Virol, 2010). Ce modèle d'infection a ensuite été reproduit sur des souris KO pour des molécules impliquées dans l'activation des macrophages (CCR2; IRF3&7). L'objectif du suivi immunopathologique et du phénotypage lésionnel est la compréhension à l'échelle moléculaire des mécanismes impliqués dans la physiopathogénie des douleurs articulaires chroniques associées à l’infection par le virus du Chikungunya.
D’autre part nous continuons l’exploration de la physiopathogénie des alphavirus sur le modèle simien en comparant les effets à moyen terme de l’infection par les virus Ross River et Chikungunya.
Publication
Rudd PA, Wilson J, Gardner J, Larcher T, Babarit C, Le TT, Anraku I, Kumagai Y, Loo YM, Gale M Jr, Akira S, Khromykh AA, Suhrbier A. Interferon Response Factors 3 and 7 Protect against Chikungunya Virus Hemorrhagic Fever and Shock. J Virol, 2012, 86 : 9888-98
Communication
Dupuis Maguiraga L, Larcher T, Vezmar K, Dereudre-Bosquet N, Babarit C, Delache B, Le Grand R, Roques P. Physiopathologie de l’infection par les alphavirus arthrogéniques: comparaison entre le virus de la rivière Ross et le virus Chikungunya. In: Journées Francophones de Virologie, Paris, 29-30 mars 2012
Identification de facteurs de virulence de virus Influenza chez le poulet et le canard
Étude initiée en avril 2007 avec Nadia Naffakh (Institut Pasteur, Génétique moléculaire des virus respiratoires, Paris) et Daniel Marc (Département : Santé animale, Unité : IASP, Nouzilly) dans le cadre d’un PTR INRA-IP et poursuivie à partir de mai 2008 grâce au FRIA. Un financement par l’ICSA a été obtenu pour les années 2011 et 2012.
Les virus de la grippe aviaire sont identifiés comme un problème majeur de santé publique en raison de leur capacité à être transmis épisodiquement à l'Homme sous forme pandémique (pandémie de grippe A en 2009 et risque ressenti de pandémie de grippe H5N1 depuis les premiers cas chez l’Homme en 1997). Une meilleure compréhension des mécanismes moléculaires à l'origine de l'acquisition de cette capacité à franchir les barrières d'espèces apparait nécessaire.
L'analyse lésionnelle et l'étude de la distribution tissulaire du virus chez le canard et la poule permettent de documenter et de comparer la pathogénicité de différentes souches virales mutantes obtenues par génétique inverse par rapport au virus sauvage. L'objectif de cette étude est de comprendre les mécanismes précoces à l'origine du passage des barrières d'espèces.
Publication
Hoffmann T, Munier S, Larcher T, Soubieux D, Ledevin M, Esnault E, Tourdes A, Croville G, Guérin JL, Quéré P, Volmer R, Naffakh N, Marc D. Length variations in the NA stalk of an H7N1 influenza virus have opposite effects on viral excretion in chickens and ducks. J Virol, 2012, 86 : 584-8
Communication
Hoffmann TW, Munier S, Larcher T, Soubieux D, Esnault E, Tourdes A, Croville G, Guérin JL, Quére P, Volmer R, Naffakh N, Marc D. La longueur de le tige de la neuraminidase d’un virus influenza aviaire H7N1 produit des effets opposés chez le poulet et le canard. In: Journées Francophones de Virologie, Paris, 29-30 mars 2012
Altérations physiopathologiques de poissons zèbres exposés à des polluants environnementaux
Programme ANR ConPhyPop de 3 ans initié en septembre 2009 et coordonné par X. Cousin (IFREMER, L’Houmeau).
De nombreux contaminants d'origine anthropique, émis à des niveaux croissants dans l'environnement, s'accumulent dans les milieux aquatiques où leur impact sous forme de mélanges complexes avec les sédiments est inconnu. L'objectif du programme ConPhyPop est de documenter les conséquences physiologiques de l'exposition aux hydrocarbones polyaromatiques (PAH) en utilisant le poisson zèbre comme espèce modèle.
La contribution d'APEX consiste à identifier les conséquences physiopathologiques à long terme en particulier l’effet cancérigène. Les premiers travaux ont pu mettre en évidence des effets sur les fonctions de l'immunité (augmentation de la sensibilité à certains agents pathogènes), de la reproduction (dégénérescence folliculaire) et sur la cancérogénèse (identification de lésions prénéoplasiques et néoplasiques).
Communication
Cousin X, Daouk T, Péan S, Vignet C, Larcher T, Roupsard F, Lyphout L, Leguay D, Loizeau V, Bégout M. Long term food-exposure to PCB mixtures induces reproductive and behavioural disruptions in Zebrafish. In: SETAC World congress, Berlin, 20-24 mai 2012
Modulation de la réponse immunitaire vis-à-vis du transgène en thérapie génique
Collaboration avec Oumeya Adjali (UMR 649 INSERM, Nantes).
De plus en plus d’études, sur des modèles animaux et maintenant chez l’homme, décrivent comme immunogène le transfert de gène in vivo à l’aide de vecteurs AAV recombinants (AAVr), et ce en particulier lorsqu’ils sont administrés dans le muscle. Les réponses immunes observées, à la fois humorales et cellulaires, peuvent être dirigées contre le transgène ou à l’encontre de la capside virale, et sont responsables d’une inefficacité du transfert de gène, et parfois même d’une destruction délétère d’origine cytotoxique du tissu transduit.
Nous participons à un projet visant à disséquer les mécanismes mis en jeu lors de la réponse immune vis-à-vis du transgène. La relation entre le vecteur AAV, le site d’injection musculaire et le système immunitaire locorégional est explorée après injection intramusculaire (IM) d’un AAVr de sérotype 8 exprimant l’eGFP chez la souris et le macaque. La contribution d’APEX à cette étude consiste à rechercher la présence de transgène dans le muscle, la rate et les ganglions drainant, à identifier les cellules transduites dans les différents organes et à caractériser les foyers inflammatoires.
Communication
Gernoux G, Devaux M, Dubreil L, Jaulin N, Guibaud M, Deschamps JY, Larcher T, Guigand L, Dutilleul M, Cherel Y, Moullier P, Adjali O. Macaque immune responses following AAV-based gene transfer to the skeletal muscle: addressing the method of vector delivery. In: ESGCT, Versailles, 25-29 octobre 2012
Epigénétique et expression d’un transgène à partir d’un vecteur AAV après injection intramusculaire chez une souris saine
Collaboration avec P. Moullier et A. Léger (U1089 INSERM, Nantes).
Le transfert de gène à l’aide de vecteurs AAV recombinants (AAVr) permet une expression stable du transgène in vivo après une simple injection intramusculaire d’un vecteur AAVr. L’objectif est d’évaluer l’impact des modifications épigénétiques sur le niveau d’expression d’une protéine thérapeutique après administration intramusculaire (IM) d’un vecteur AAVr.
Deux études ont été mises en place successivement chez la souris saine et chez la souris mdx, modèle de la dystrophie de Duchenne, pour évaluer l’implication de mécanismes épigénétiques sur l’expression de la protéine thérapeutique dans 2 tissus quiescents : le muscle squelettique et le foie après administration IM d’un AAV 2/8-RSV-eGFP. La contribution d’APEX a cette étude consiste à la recherche de transgène dans le muscle, la quantification du transgène exprimé dans le muscle et la caractérisation des foyers inflammatoires associés à l’expression du transgène.
Caractérisation de la population cellulaire infectée par le CAEV dans les tissus de l’appareil génital de la chèvre et du bouc
Collaboration avec l’UPSP RSB ONIRIS et la Faculté de Médecine Vétérinaire de l’Université de AL-Baath, Hama, Syrie
Ce projet dirigé par Francis Fieni (UPSP RSB Oniris), a pour objectif de caractériser les populations cellulaires infectées par le virus de l’encéphalite arthrite caprine (CAEV) dans les tissus de l’appareil génital de la chèvre et du bouc. Notre contribution à cette étude consiste à participer au choix des anticorps et des sondes fluorescentes, valider les protocoles d’immunomarquages, réaliser les acquisitions en microscopie confocale et les analyser. Nous avons montré que les cellules épithéliales de la corne utérine de chèvre étaient les cellules cibles du CAEV. Nous avons également montré la présence de CAEV dans les testicules de Boucs infectées.
Publications
Al Ahmad MZA, Dubreil L, Chatagnon G, Khayli Z, Theret M, Martignat L, Chebloune Y, Fieni F. Goat uterine epithelial cells are susceptible to infection with caprine arthritis encephalitis virus (caev) in vivo. Vet Res. 2012;43:1-7
Lamara A, Fieni F, Chatagnon G, Larrat M, Dubreil L, Chebloune Y. Caprine arthritis encephalitis virus (CAEV) replicates productively in cultured epididymal cells from goats. Comp Immunol Microbiol Infect Dis. 2013; S0147-9571(13)00016-7
Caractérisation phénotypique des cellules dendritiques, stimulées par un agoniste de la voie β2-adrénergique
Collaboration avec J. Hervé et P. Blancou (UMR 707 IECM ONIRIS).
L’objectif est de déterminer les effets in vitro et in vivo de la stimulation β2-adrénergique sur la cross présentation des antigènes par les cellules dendritiques. Dans ce projet, nous apportons notre expertise en microscopie confocale et en analyse morphométrique pour phénotyper les cellules dendritiques avant et après stimulation. Nous avons localisé et quantifié NFκB ainsi qu’un peptide spécifique du complexe CMH sur les cellules dendritiques avant et après stimulation, avec du salbutamol, agoniste β2-adrénergique.
Publication
Hervé J, Dubreil L, Tardif V, Terme M, Pogu S, Anegon I, Rozec B, Gauthier C, Bach J, Blancou P. B2-adrenoreceptor agonist inhibits antigen cross-presentation by dendritic cells. J Immunol. 2013;180:3163-3171
