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L’atelier transparisation avait pour objectif de présenter différentes techniques pour marquer les adipocytes et de présenter les différentes modalités de transparisation ainsi que les contraintes liées à la transparisation du tissu adipeux.  Les échantillons transparisés ont été observés avec le microscope à feuille de lumière BLAZZ

L’objectif de l'atelier multiplexing était d'une part d'apprendre différentes techniques de multimarquages fluorescents pour analyser la réponse des cellules immunitaires sur des coupes de tissus FFE et d'autre part d'évaluer le potentiel d’un spinning disque et de la microscopie confocale spectrale pour imager les multimarquages.. A la fin de l'atelier, les participants connaissaient les différentes étapes nécessaires à la réalisation du multiplexage des cellules immunitaires sur coupe de tissu. Ils savaient sélectionner les sondes fluorescentes compatibles avec le système utilisé pour l'imagerie des coupes de tissus. Ils ont appris à   évaluer deux systèmes d'acquisition des images utilisant d'une part, une technique de sectionnement optique à grande vitesse (disque tournant) et d'autre part, une méthode de déconvolution spectrale. L’analyse quantitative des cellules immunitaires a été réalisée à l'aide de logiciels open source comme QuPath (Atelier Thierry Pécot)