Activités 2023

Faits marquants

APEX s'est équipée d'un microscope à feuille de lumière installé en aout 2023 sur la plateforme. L'ultramicroscope BLAZE présente trois points forts essentiels pour explorer la biodistribution d'agents infectieux ou thérapeutiques ou la microstructure tridimensionnelle d'un organe entier avec une résolution subcellulaire : (i) il est adapté à l'exploration de grands échantillons ( ex. souris entière), (ii) il est compatible avec toutes les techniques de transparisation, en particulier celles qui utilisent des solvants organiques qui sont les plus efficaces et (iii) il représente un système ouvert qui permet l'observation d'échantillons à différents grossissements. Cet équipement de haute technologie vient compléter l'ensemble des outils disponibles sur les plateformes d'imagerie de la région du Grand Ouest et contribuera au renforcement des activités de recherche menées par la communauté scientifique utilisatrice des plateformes de Biogenouest.

Publications

1.         Flavien Bizot, Abdallah Fayssoil, Cécile Gastaldi, Tabitha Irawan, Xaysongkhame Phongsavanh, Arnaud Mansart, Thomas Tensorer, Elise Brisebard, Luis Garcia, Rudolph L Juliano, and Aurélie Goyenvalle. Oligonucleotide Enhancing Compound Increases Tricyclo-DNA Mediated Exon-Skipping Efficacy in the Mdx Mouse Model. Cells, 12(5):702, February 2023. doi: 10.3390/cells12050702. URL https://hal.science/hal-04021748.
2.         Petra ter Brugge, Sarah Moser, Ivan Bièche, Petra Kristel, Sabrina Ibadioune, Alexandre Eeck-houtte, Roebi de Bruijn, Eline van der Burg, Catrin Lutz, Stefano Annunziato, Julian de Ruiter, Julien Masliah Planchon, Sophie Vacher, Laura Courtois, Rania El-Botty, Ahmed Dahmani, Elodie Montaudon, Ludivine Morisset, Laura Sourd, Léa Huguet, Heloise Derrien, Fariba Nemati, Sophie Chateau-Joubert, Thibaut Larcher, Anne Salomon, Didier Decaudin, Fabien Reyal, Florence Coussy, Tatiana Popova, Jelle Wesseling, Marc-Henri Stern, Jos Jonkers, and Elisabetta Marangoni. Homologous recombination deficiency derived from whole-genome sequencing predicts platinum response in triple-negative breast cancers. Nature Communications, 14(1):1958, December 2023. doi: 10.1038/s41467-023-37537-2. URL https://hal.inrae.fr/hal-04072477
3.         Laurence Dubreil, Noreddine Damane, Romain Fleurisson, Marine Charrier, Julien Pichon, Isabelle Leroux, Cindy Schleder, Mireille Ledevin, Thibaut Larcher, Frédéric Jamme, John Puentes, and Karl Rouger. Specific and label-free endogenous signature of dystrophic muscle by Synchrotron deep ultraviolet radiation. Scientific Reports, 13(1):10808, December 2023. doi: 10.1038/s41598-023-37762-1. URL https://hal.inrae.fr/hal-04157970
4.         Rania El-Botty, Ludivine Morriset, Elodie Montaudon, Zakia Tariq, Anne Schnitzler, Marina Bacci, Nicla Lorito, Laura Sourd, Léa Huguet, Ahmed Dahmani, Pierre Painsec, Heloise Derrien, Sophie Vacher, Julien Masliah-Planchon, Virginie Raynal, Sylvain Baulande, Thibaut Larcher, Anne Vincent-Salomon, Guillaume Dutertre, Paul Cottu, Géraldine Gentric, Fatima Mechta-Grigoriou, Scott Hutton, Keltouma Driouch, Ivan Bièche, Andrea Morandi, and Elisabetta Marangoni. Oxidative phosphorylation is a metabolic vulnerability of endocrine therapy and palbociclib resistant metastatic breast cancers. Nature Communications, 14(1):4221, July 2023. doi: 10.1038/s41467-023-40022-5. URL https://hal.science/hal-04205847
5.         Laurent Ferraris, Aurélie Balvay, Deborah Bellet, Johanne Delannoy, Claire Maudet, Thibaut Larcher, Jean-Christophe Rozé, Catherine Philippe, Thierry Meylheuc, Marie-José Butel, Sylvie Rabot, and Julio Aires. Neonatal necrotizing enterocolitis: Clostridium butyricum and Clostridium neonatale fermentation metabolism and enteropathogenicity. Gut microbes, 15(1):2172666, February 2023. doi:10.1080/19490976.2023.2172666. URL https://hal.inrae.fr/hal-04106612.
6.         Antoine Gaillac, Claire Gourin, Laurence Dubreil, Romain Briandet, Hervé Prévost, and Emmanuel Jaffrès. Biofilm formation of the food spoiler Brochothrix thermosphacta on different industrial surface materials using a biofilm reactor. Food Microbiology, page 104457, December 2023. doi: 10.1016/j.fm.2023.104457. URL https://hal.inrae.fr/hal-04369019.
7.         Tristan Méric, Julien Issard, Thomas Maufras, Marine Hugonnard, Odile Senecat, Alexis Lecoindre, Rodolfo Oliveira Leal, Coralie Bertolani, Olivier Toulza, Patrick Lecoindre, Elise Brisebard, Mireille Ledevin, Thibaut Larcher, Amandine Drut, Elodie Darnis, and Juan Hernandez. Recurrence and survival in dogs with excised colorectal polyps: A retrospective study of 58 cases. Journal of Veterinary Internal Medicine, pages 1-10, January 2023. doi: 10.1111/jvim.16876. URL https://hal.inrae.fr/hal-04234504
8.         Rosine Onclercq-Delic, Géraldine Buhagiar-Labarchède, Sophie Leboucher, Thibaut Larcher, Mireille Ledevin, Christelle Machon, Jérôme Guitton, and Mounira Amor-Guéret. Cytidine deaminase deficiency in mice enhances genetic instability but limits the number of chemically induced colon tumors. Cancer Letters, 555:216030, February 2023. doi: 10.1016/j.canlet.2022.216030. URL https://hal.inrae.fr/hal-03986755
9.         Florian Tomal, Guillaume Sadrin, Pauline Gaboriaud, Edouard Guitton, Laura Sedano, Nathalie Lallier, Christelle Rossignol, Thibaut Larcher, Elodie Rouille, Mireille Ledevin, Rodrigo Guabiraba, Anne Silvestre, Sonia Lacroix-Lamandé, Catherine Schouler, Fabrice Laurent, and Françoise I.Bussière. The caecal microbiota promotes the acute inflammatory response and the loss of the intestinal barrier integrity during severe Eimeria tenella infection. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 13:1250080, August 2023. doi: 10.3389/fcimb.2023.1250080. URL https: //hal.inrae.fr/hal-04187670
10.       Castanha N, Challois S, Grenier D, Le-Bail P, Dubreil L, Lucas T. Multiphoton microscopy is a non destructive label-free approach to investigate the 3D structure of gas cell walls in bread dough. Sci Rep. 2023 Aug 26;13(1):13971. doi: 10.1038/s41598-023-39797-w. PMID: 37634004; PMCID: PMC10460382.